CILA o permesso di costruire

buongiorno. Devo fare dei lavori interni in due unita` immobiliari contiguie in un palazzol del centro storico all`interno di vincolo ambientale per la presenza di un fiume per uno dei quali ci sara` il cambio di destinazione d`uso da ripostiglio ad apprtamento. il geometra del comune appena arrivato in sostituzione dell`esperto che e` in ferie,dice che non si puo` fare la cila senza specificare il perche` anche a richiesta diretta. Secondo voi e` per la presenza del vincolo (ma sono opere interne) o per la presenza del cambio di destinazione d`uso? un altra domanda: esiste una deroga ai rapporti aeroilluminanti dato che l`immobile si trova in centro storico? grazie a chi mi vorra` rispondere.