APE per appartamento con unico generatore e due termostati indipendenti

Salve a tutti, e scusate la domanda banale.
Devo fare l'APE di un subalterno costituito da un appartamento e un sottotetto non riscaldato. Premetto che sto usando il software Termolog.
Nell'appartamento c'è un unico generatore per riscaldamento e ACS, ma zona giorno e zona notte hanno due termostati indipendenti per cui è possibile tenere la zona notte spenta e quella giorno accesa e viceversa.
Come concretizzo questa situazione nella certificazione energetica? Devo creare due zone termiche distinte per zona notte e zona giorno? Oppure è sufficiente creare due locali distinti nel momento in cui creo l'involucro (su termolog si crea graficamente tramite una polilinea chiusa)?
Vi ringrazio per qualunque suggerimento!